Государство-член, принимающее очередную встречу Глав государств и/или правительств становится Председателем СВМДА до следующей встречи Министров иностранных дел. Государство-член, принимающее очередную встречу Министров иностранных дел становится Председателем СВМДА до следующей встречи Глав государств и/или правительств.
Республика Казахстан была Председателем с 2002 по 2010 гг.
Турция приняла Председательство СВМДА в 2010г. на период 2010-2012г. Срок Председательства Турции был в дальнейшем прподлен до 2014г.
Китайская Народная Республика приняла Председательство в СВМДА на период 2014-2016 гг. Срок Председательства Китая был затем продлен до 2018г.
Республика Таджикистан приняла Председательство в СВМДА на период 2018-2020 г. 24 сентября 2018 г. в Нью-Йорке
Председатель СВМДА несет ответственность за координацию и информационное взаимодействие в ходе текущей деятельности СВМДА. Председатель осуществляет контроль над различными встречами СВМДА, координирует и отчитывается о деятельности СВМДА. С согласия государств-членов Председатель представляет СВМДА в Организации Объединенных Наций и других международных форумах.